Per spegnere un motore diesel, è necessario interrompere l'alimentazione di carburante al motore. Questa operazione può essere eseguita manualmente chiudendo la valvola del carburante o utilizzando un meccanismo di spegnimento automatico. Quando viene interrotta l'alimentazione del carburante, il motore continuerà a funzionare per un breve periodo fino all'esaurimento del carburante nei cilindri. Una volta consumato tutto il carburante, il motore smetterà di funzionare.
Alcuni motori diesel sono dotati di un sistema di candelette che facilita l'avviamento del motore quando fa freddo. Le candelette riscaldano l'aria nei cilindri, facilitando l'accensione del gasolio. Allo spegnimento del motore si spengono automaticamente anche le candelette.
I motori diesel sono inoltre dotati di una funzione di sicurezza chiamata limitatore di velocità. Il limitatore di velocità è progettato per impedire che il motore giri troppo velocemente. Se la velocità del motore supera un certo limite, il limitatore di velocità interromperà automaticamente l'alimentazione di carburante al motore.